Zakladatelem a prvním rektorem vysoké školy byl prof.MUDr.et MVDr.h.c.Eduard Babák.Vlastní výuka byla zahájena 17.listopadu 1919.Z počátku se univerzita vyvíjela jako monofakultní vysoká škola zaměřená na veterinární lékařství (zvěrolékařství).V roce 1975 byly na vysoké škole zřízeny dva obory, a to obor všeobecné veterinární lékařství (později přejmenovaný na veterinární lékařství) a obor veterinární lékařství – hygiena potravin (později přejmenovaný na veterinární hygiena a ekologie).V roce 1990 vznikly na vysoké škole dvě fakulty - Fakulta všeobecného veterinárního lékařství (dnešní Fakulta veterinárního lékařství) zaměřená na veterinární lékařství a Fakulta veterinární hygieny a ekologie zaměřená na veterinární hygienu.V roce 1991 vznikla třetí fakulta – Fakulta farmaceutická, zaměřená na farmacii.Od roku 1994 se vysoká škola nazývá Veterinární a farmaceutická univerzita Brno.V roce 2020 Farmaceutická fakulta odešla na Masarykovu univerzitu.Od 1.4.2021 nese univerzita název Veterinární univerzita Brno.
